不稳定的Omicron变异株是以牺牲适应性为代价的？希望如此

【本文由“灵瑾”推荐，来自《世卫组织：全球已有77个国家和地区出现奥密克戎毒株，几星期后此轮疫情可能将达到顶峰》评论区，标题为小编添加】

笔者注：因Omicron疫情及其研究进展，本文对2021-12-15原文作了补充和个别修改

下面图1是美国CDC官网https://covid.cdc.gov/上的Omicron（B.1.1.529）分布地图（2021.12.15）有76个国家报告了Omicron。

下面图2是全球病原体实时跟踪网https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global上的全球新型冠状病毒基因组二次抽样的2020年、2021年发育树（图中放不下2019年的），左上角不同颜色标注了COVID的不同分支，Omicron是大红色，在分支图中下方最右端。

下面图3是omicron子分支放大图，21M(omicron)先后有两个分支：21K(omicron)和21L(omicron)。分支21K(omicron)最早的一株是2021-11-16由南非豪登Stellenbosch大学实验室提交，有94个核苷酸突变。最后几株是在2021-12-17，其中一株是莫桑比克国立沙特实验室（INS）提交的，有98个核苷酸突变。21K(omicron)全部毒株均属于BA.1谱系（血统），传染力较强但毒力较弱，病症多为轻型和无症状，被称为COVID的“温和”版本，至12月19日在英国出现12例死亡。

​科学家在2021-12-26首次检测到了omicron的一个新的亚种分支21L(omicron)，被称为“偷偷摸摸”的BA.2新谱系，它由卡塔尔大学/卡塔尔基因组计划（QGP）实验室提交，有119核苷酸突变。最新出现是在一株是2022-01-16，由印度加德满都大学医院杜利赫勒医院实验室提交，有127核苷酸突变。

BA.2谱系的特征是，虽新出现了许多BA.1没有的核苷酸突变，但同时又放弃了BA.1的一些核苷酸突变（详见https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/367），重要的是放弃了BA.1独特的S基因缺失突变（S-gene dropout mutation ）这使得常规的核酸检测不容易发现它，因而难以基于常规的聚合酶链反应或聚合酶链反应来对它进行评估，所以加州大学圣地亚哥分校的遗传学家Niema Moshiri告诉《每日野兽》记者说“使用原来的阿尔法病毒测试来寻找Omicron的实验室技术人员可能会错过BA.2病例”。

目前科学家正在积极探究Omicron可能的继续突变将如何影响新冠疫。对人体免疫的选择压力迫使病毒产生适应性突变而生存。希望如德国病毒学家Meyer所指出的那样，不稳定的Omicron的突变是以牺牲适应性为代价的。病毒一旦失去了免疫选择压力，则会发生向野生型（wild type）反向突变(reverse mutation )，这些变体有可能成为大流行后的一种新常态，像普通流感一样。

伦敦卫生和热带医学学院的流行病学家Adam Kucharsk说：病毒引发新流行病的最简单方法，是随着时间的推移逃避免疫，这与我们看到的季节性冠状病毒相似。病毒逃避免疫和降低传染性的进化路径，在流感等已有的呼吸道病毒中很是常见。西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心的进化生物学家Jesse Bloom则明确表示：Omicron的崛起表明它已经找到了逃避人类免疫的方法，这种新的病原体不会被根除，相反，它将与在人类中传播了几十年、导致相对轻微感冒的四种“季节性”冠状病毒并存，从而成为第五种在人类中永久存在的冠状病毒地方性疾病。（详见https://www.nature.com/articles/d41586-021-03619-8）

欧洲是Omicron重灾区。据欧盟CDC官网https://www.ecdc.europa.eu/2021年12月19日报道，欧盟/欧洲经济区28个国家报告了确诊Omicron病例总数4691例，所有病例都是无症状或轻微的。Omicron从2021年12月初入侵美国，三周内就占据了总病例的73.2％，使得美国确诊病例大幅上升。

现在Omicron已经肆虐一个月了，下面两图分别是的欧州和美国每日确诊病例和死亡病例的7天平均值曲线（https://ourworldindata.org）。总体可见，与Delta病毒相比，Omicron表现出了传播快、感染多，但病症轻、死亡少的疫情特征，映证了上述的预测。这从病死率（=累计死亡/累计确诊*100%）可以看出，Omicron出现这一个月来，欧洲病死率从1.79%降到1.36%，美国病死率从1.57%降到 1.21% ,全球病死率从1.93%降到 1.57%。